Package - gmap

Package:  gmap
apt-get install gmap
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Primary informations

Download package: http://deb.debian.org/debian/pool/main/g/gmap/gmap_2024-11-20+ds-2_amd64.deb (Size: 32.9MiB)

PropertyValue
Packagegmap
Version2024-11-20+ds-2
Installed-Size268823
MaintainerDebian Med Packaging Team
Architectureamd64
Dependsperl:any, libbz2-1.0, libc6 (>= 2.34), zlib1g (>= 1:1.2.6)
Descriptionspliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
Description-md5d1daaf58e59d1f735c184407a7d778b3
Homepagehttp://research-pub.gene.com/gmap
Tagfield::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, role::program, use::analysing
Sectionscience
Priorityoptional
Filenamepool/main/g/gmap/gmap_2024-11-20+ds-2_amd64.deb
Size34494256
MD5sum5db66e90bb3a01019ba4413a5bb3e1bb
SHA256d9a9df9a58e542968b581aee2ac75d14571b5ef5306fe021d1c9b6805926a01e

Files in package

  • /usr/bin/gmap
  • /usr/bin/gmap.avx2
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  • /usr/bin/gmap.sse42
  • /usr/bin/gmap.ssse3
  • /usr/bin/gmap_build
  • /usr/bin/gmapl
  • /usr/bin/gmapl.avx2
  • /usr/bin/gmapl.avx512
  • /usr/bin/gmapl.nosimd
  • /usr/bin/gmapl.sse2
  • /usr/bin/gmapl.sse41
  • /usr/bin/gmapl.sse42
  • /usr/bin/gmapl.ssse3
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  • /usr/bin/gsnapl.avx2
  • /usr/bin/gsnapl.avx512
  • /usr/bin/gsnapl.nosimd
  • /usr/bin/gsnapl.sse2
  • /usr/bin/gsnapl.sse41
  • /usr/bin/gsnapl.sse42
  • /usr/bin/gsnapl.ssse3
  • /usr/lib/gmap/atoiindex
  • /usr/lib/gmap/cmetindex
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  • /usr/lib/gmap/dbsnp_iit
  • /usr/lib/gmap/ensembl_genes
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  • /usr/lib/gmap/get-genome
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  • /usr/lib/gmap/gff3_introns
  • /usr/lib/gmap/gff3_splicesites
  • /usr/lib/gmap/gmap
  • /usr/lib/gmap/gmap.avx2
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  • /usr/lib/gmap/gmap.nosimd
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  • /usr/lib/gmap/gmap.sse41
  • /usr/lib/gmap/gmap.sse42
  • /usr/lib/gmap/gmap.ssse3
  • /usr/lib/gmap/gmap_build
  • /usr/lib/gmap/gmap_cat
  • /usr/lib/gmap/gmap_process
  • /usr/lib/gmap/gmapindex
  • /usr/lib/gmap/gmapl
  • /usr/lib/gmap/gmapl.avx2
  • /usr/lib/gmap/gmapl.avx512
  • /usr/lib/gmap/gmapl.nosimd
  • /usr/lib/gmap/gmapl.sse2
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  • /usr/lib/gmap/gmapl.sse42
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  • /usr/lib/gmap/gsnapl.avx512
  • /usr/lib/gmap/gsnapl.nosimd
  • /usr/lib/gmap/gsnapl.sse2
  • /usr/lib/gmap/gsnapl.sse41
  • /usr/lib/gmap/gsnapl.sse42
  • /usr/lib/gmap/gsnapl.ssse3
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  • /usr/lib/gmap/psl_splicesites
  • /usr/lib/gmap/snpindex
  • /usr/lib/gmap/trindex
  • /usr/lib/gmap/vcf_iit
  • /usr/share/doc/gmap/NOTICE
  • /usr/share/doc/gmap/README.Debian
  • /usr/share/doc/gmap/README.gz
  • /usr/share/doc/gmap/changelog.Debian.gz
  • /usr/share/doc/gmap/changelog.gz
  • /usr/share/doc/gmap/copyright
  • /usr/share/doc/gmap/examples/tests.tar.xz
  • /usr/share/lintian/overrides/gmap
  • /usr/share/man/man1/gmap.1.gz
  • /usr/share/man/man1/gmap_build.1.gz
  • /usr/share/man/man1/gmapl.1.gz
  • /usr/share/man/man1/gsnap.1.gz
  • /usr/share/man/man1/gsnapl.1.gz